MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
2	NC_017269	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	384422537
3	NC_017269	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
4	NC_017269	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	384422537
5	NC_017269	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
6	NC_017269	AGC	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
7	NC_017269	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422538
8	NC_017269	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	384422538
9	NC_017269	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
10	NC_017269	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
11	NC_017269	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	384422538
12	NC_017269	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	384422538
13	NC_017269	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	384422538
14	NC_017269	AAAAGC	2	12	1546	1557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384422538
15	NC_017269	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	384422538
16	NC_017269	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	384422538
17	NC_017269	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
18	NC_017269	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
19	NC_017269	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
20	NC_017269	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	384422538
21	NC_017269	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
22	NC_017269	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
23	NC_017269	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	384422538
24	NC_017269	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422538
25	NC_017269	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	384422538
26	NC_017269	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	384422538
27	NC_017269	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	384422538
28	NC_017269	T	6	6	2190	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	384422538
29	NC_017269	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422538
30	NC_017269	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
31	NC_017269	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
32	NC_017269	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
33	NC_017269	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	384422538
34	NC_017269	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	384422538
35	NC_017269	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422538
36	NC_017269	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	384422538
37	NC_017269	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422538
38	NC_017269	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
39	NC_017269	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
40	NC_017269	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
41	NC_017269	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
42	NC_017269	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	384422538
43	NC_017269	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
44	NC_017269	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422538
45	NC_017269	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	384422538
46	NC_017269	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	384422538
47	NC_017269	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
48	NC_017269	TGAGAT	2	12	3415	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422539
49	NC_017269	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	384422539
50	NC_017269	AGCA	2	8	3487	3494	50 %	0 %	25 %	25 %	384422539
51	NC_017269	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422539
52	NC_017269	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
53	NC_017269	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	384422539
54	NC_017269	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
55	NC_017269	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422539
56	NC_017269	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	384422539
57	NC_017269	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	384422539
58	NC_017269	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
59	NC_017269	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	384422539
60	NC_017269	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422540
61	NC_017269	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
62	NC_017269	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422540
63	NC_017269	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
64	NC_017269	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422540
65	NC_017269	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	384422541
66	NC_017269	A	7	7	4548	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	384422541
67	NC_017269	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422541
68	NC_017269	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	384422541
69	NC_017269	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
70	NC_017269	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422542
71	NC_017269	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	384422542
72	NC_017269	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	384422542
73	NC_017269	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422542
74	NC_017269	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	384422542
75	NC_017269	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	384422542
76	NC_017269	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
77	NC_017269	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
78	NC_017269	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
79	NC_017269	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	384422542
80	NC_017269	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422542
81	NC_017269	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422542
82	NC_017269	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422542
83	NC_017269	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422542
84	NC_017269	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
85	NC_017269	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
86	NC_017269	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	384422543
87	NC_017269	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422543
88	NC_017269	TG	3	6	6051	6056	0 %	50 %	50 %	0 %	384422543
89	NC_017269	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
90	NC_017269	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	384422543
91	NC_017269	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	384422543
92	NC_017269	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	384422543
93	NC_017269	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422543
94	NC_017269	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	384422543
95	NC_017269	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	384422543
96	NC_017269	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	384422543
97	NC_017269	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
98	NC_017269	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422543
99	NC_017269	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
100	NC_017269	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
101	NC_017269	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	384422544
102	NC_017269	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
103	NC_017269	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	384422544
104	NC_017269	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
105	NC_017269	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	384422544
106	NC_017269	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
107	NC_017269	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	384422544
108	NC_017269	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
109	NC_017269	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422544
110	NC_017269	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
111	NC_017269	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422544
112	NC_017269	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	384422544
113	NC_017269	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	384422544
114	NC_017269	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422544
115	NC_017269	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422544
116	NC_017269	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	384422544
117	NC_017269	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
118	NC_017269	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	384422544
119	NC_017269	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
120	NC_017269	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	384422544
121	NC_017269	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	384422544
122	NC_017269	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
123	NC_017269	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422544
124	NC_017269	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422544
125	NC_017269	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	384422544
126	NC_017269	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	384422544
127	NC_017269	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
128	NC_017269	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
129	NC_017269	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
130	NC_017269	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
131	NC_017269	ATAG	2	8	8003	8010	50 %	25 %	25 %	0 %	384422544
132	NC_017269	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422544
133	NC_017269	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422544
134	NC_017269	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422544
135	NC_017269	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	384422544
136	NC_017269	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422545
137	NC_017269	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422545
138	NC_017269	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422545
139	NC_017269	GCC	2	6	8614	8619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422545
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157	NC_017269	GTC	2	6	12853	12858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
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161	NC_017269	GCA	2	6	13125	13130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422546
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249	NC_017269	ATT	2	6	18442	18447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422548
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256	NC_017269	GTG	2	6	18783	18788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422548
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260	NC_017269	A	6	6	18888	18893	100 %	0 %	0 %	0 %	384422548
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262	NC_017269	GGAT	2	8	19123	19130	25 %	25 %	50 %	0 %	384422548
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